2011年3月，马来西亚高教部副部长何国忠在与我国教育部副部长郝平会晤时提出，希望有一所中国大学到马来西亚办分校，教育部经研究选中厦门大学。2012年11月，厦大正式同意接受马方提出的邀请。“师生都很支持，认为这符合厦大建设国际性大学的发展战略。”厦门大学校长朱崇实说。

厦门大学是由爱国侨领陈嘉庚于1921年创办的。92年之后，厦大回到嘉庚先生成长的马来西亚创办分校，这是历史的回馈。

厦门大学的实力也让马来西亚十分看重。黄家定表示，厦门大学是一所与东南亚接触较广、国际化倾向比较明显的中国重点高校，厦大的前沿学科如东南亚研究、海洋科学、工科、商科、会计、中西医药都是中西兼容，有很强的学术品牌，是中国当代软实力的表征。

厦门大学马来西亚分校是一个独立法人，是在马来西亚登记注册的一所大学，同时又是厦大的一个组成部分，管理模式将实行董事会领导下的校长负责制。分校将参照当地大学学费来制定学费，原则上低于其他在马办学的外国大学、高于马来西亚本土私立大学。

“作为第一所入驻马来西亚的亚洲知名大学，厦门大学在东南亚的声誉很好，在东南亚各国都有庞大的成功校友群。”黄家定说。分校除能带动更多中国学生来马学习外，马来西亚也能借助厦大的声誉及在东南亚国家中的广泛网络，带动更多外国学生来马深造。

马来西亚南方大学校长祝家华表示，厦门大学到马来西亚设立分校将会与本地私立、国立大学产生良性竞争，提升教学素质，让马来西亚高等教育发展更趋多元，并吸引更多国际学生来马学习，同时也将为马来西亚学子提供更多选择。

厦门大学马来西亚分校预计将为马来西亚华文独立中学学生提供更多升学途径。马来西亚槟城韩江中学是一所华文独立中学，该校校长周美俐表示，华文独中每年都会参加由马来西亚董教总举办的统考，但这一考试成绩却不被马来西亚教育部所承认，因此韩江中学高中生目前升学的途径仅限于国外大学和马来西亚国内私立大学。因此，厦大在马来西亚设立分校，将会为华文独中学生升学提供更多途径。