4、检疫方式：
a、锚地检疫：来自检疫传染病疫区的;有检疫传染病人、疑似传染病人或有人因意外死亡而死因不明的;发现有啮齿动物异常死亡的;《除鼠或免于除鼠证书》失效的;装载或动物的;没有申报下述三种检疫的。
b、随航检疫：旅游创、军事船、要人访问乘船等特殊船舶，遇有特殊情况如有病人需要救治、特殊物资急需装卸、船舶急需抢修等，可申请。
c、靠泊检疫：未持我签发有效的《交通工具卫生证书》，且无应实施锚地检疫所列情况，或因天气、潮水等原因无法实施锚地检疫的船舶，可申请。
d、电子检疫：持我有效《交通工具卫生证书》，且无应实施锚地检疫所列情况的船舶，可申请。
特别要求：抵港前24小时，必须持有效《交通工具卫生证书》由船舶公司或船代向港口或锚地检验机构机构以电报形式报告。
5、检验检疫：
无染疫，出具《船舶入境卫生检疫证》;否则卫生处理，完毕出具《船舶入境检疫证》。
(二)出境卫生检疫申报
最后出境港，离境前4小时内，申报检疫。签发《交通工具出境卫生检疫证书》。
二、出入境航空器
(一)入境飞机检疫申报：
1、来自非疫区，且在飞行中未发现检疫传染病、疑似检疫传染病、或有人非因意外伤害而死并死因不明的，可由地面航空战以电讯方式申报检疫。
可以载有病人或途中有人生病或死亡;但须申报疾病名称、症状、人数或死因。
2、否则，由入境空港地面站申请检疫检疫。然后视情登机检疫并作卫生处理;此前不得擅自上下人。
来自黄热疫区的，必须出示“灭蚊证书”。
(二)飞机出境检疫：略，签发《交通工具出境卫生检疫证书》。
三、出入境列车、其他车辆的检疫申报：检疫完毕签发《运输工具检疫证书》
第三节出入境交通运输工具的动植物检疫
一、入境运输工具
(一)来自疫区的入境运输工具
1、动植物疫区的确定：根据农业部《进境动物一、二类传染病、寄生虫病名录》、《进境植物检疫危险性病、虫、杂草名录》，由质检总局结合国情确定。
2、来自疫区的必须动植物检疫，不论是否装载动植物、产品或其他检疫物。检疫合格方准起卸货物。
3、视检疫合格和卫生处理合格而分别签发《运输工具检疫证书》、《运输工具检疫处理证书》。
(二)装载入境动物的运输工具
不管是否来自动物疫区，第一时间检疫并作防疫消毒、除害处理，任何人不得上下、接触所载动物、动物产品及随同货物、物品等。
(三)入境车辆
来自疫区，不管机动与否，入境口岸消毒防疫。
(四)入境供拆解的废旧船舶、入境修理船舶
一律入境口岸施检：消毒熏蒸(船舶)或销毁(所载动植物及其产品)。
二、出境运输工具
检疫合格，装运;否则，口岸消毒——签发《运输工具检疫处理证书》——装运。证书只限本次使用。
三、装载动植物和动植物产品的过境运输工具
1、过境运输工具、装载容器必须密闭，否则不准过境;过境动物的尸体、排泄物、铺垫材料及其它废弃物，不得擅自抛弃;过境期间未经商检批准不准拆包或卸货。出境时，不再检疫。
2、抵达口岸，运输工具、装载容器外表首先做消毒处理;装载动植物必须检验检疫合格，方准过境。
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