工程进度款的支付一般按当月实际完成工程量进行结算，工程竣工后办理竣工结算。所以工程竣工前，承包人收到的工程预付款和进度款总额不超过合同总额的95%，其余5%为尾款，在工程竣工结算时除保修金外一并清算。所以，中间结算时涉及到预付款的扣除、尾 款的保留等，应注意以下几点。
1)工程量价款是指在不考虑其他计费要求下，只按完成的工程量计算的纯工程进度款，即：
工程量价款=本期完成的工程量×相应的综合单价
2)应签证的工程款是指在工程量价款的基础上考虑其他与工程款或合同价有关的计费项目。如工程量增减的调价、市场价格变动的调价、暂扣保留金(以后仍退还)等，即：
应签证的工程款=工程量价款×调价系数×(1-每个支付期的暂扣保留金比例)+其他应付款(如索赔工程变更价款等)
3)应签发付款凭证款额指在应签证的工程款的基础上再扣除应由发包人收回的款额(如扣还预付款、罚金或违约费用等)以后，在本期结算应签发付款凭证上的款额。
4.竣工结算
工程竣工验收报告经发包人认可后28天内，承包人向发包人递交竣工结算报告及完整的结算资料，双方按照协议书约定的合同价款及专用条款约定的合同价款调整内容，进行工程竣工结算。专业监理工程师审核承包人报送的竣工结算报表;总监理工程师审定竣工结算报表，与发包人、承包人协商一致后，签发竣工结算文件和最终的工程款支付证书。发包人收到资料后28天内应核实并答复，如28天内无正当理由不支付，从第29天起应按承包人同期向银行贷款利率支付拖欠利息并承担违约责任，如56天内仍不支付，承包人可以与发包人协议将工程折价，也可由承包人申请法院依法拍卖，承包人就该工程折价或拍卖的价款优先受偿。
如果工程竣工验收报告经发包人认可后28天内，承包人未能向发包人递交竣工结算报告及完整的结算资料，造成不能按时支付，发包人要求交付工程的，承包人应当交付;发包人不要求交付工程的，承包人应负责保管。
竣工结算要有严格审查，一般从以下几方面人手：
1) 核对合同条款;
2) 检查隐蔽工程验收记录;
3) 落实设计变更签证;
4) 按图核实工程数量;
5) 执行定额单价;
6) 防止各种计算误差。
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